Drexlerviridae

Tunavirus, EM-Aufnahme

Systematik
Klassifikation: Viren
Realm: Duplodnaviria[2][3]
Reich: Heunggongvirae
Phylum: Uroviricota
Klasse: Caudoviricetes[1]
Ordnung: incertae sedis
Familie: Drexlerviridae
Taxonomische Merkmale
Genom: dsDNA linear
Baltimore: Gruppe 1
Symmetrie: ikosaedrisch, tailed
(Siphoviren)
Wissenschaftlicher Name
Drexlerviridae
Links

Drexlerviridae ist die Bezeichnung einer Familie von Viren in der Klasse Caudoviricetes (Viren mit Kopf-Schwanz-Aufbau). Als natürliche Wirte dienen Bakterien, die Familie wird daher nicht-taxonomisch zu den Bakteriophagen klassifiziert. Derzeit (Stand 23. Februar 2021) gibt es offiziell vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) bestätigt vier Unterfamilien, sechs Gattungen und 75 Spezies (Arten) in dieser Familie.[4][2][5]

Die drexlerviridae haben den Morphotyp von Siphoviren; die Familie ging aus der früheren Unterfamilie Tunavirinae der inzwischen aufgelösten Familie Siphoviridae hervor.[6]

Etymologie

Der Name der Familie wurde gewählt zu Ehren des amerikanischen Erforschers des T1-Phagen Henry Drexler (1927–1991), Wake Forest University Medical Center, Winston-Salem, USA.[7]

Beschreibung

Schemazeichnung eines Virions der Spezies Escherichia-Virus T1 (Querschnitt und Seitenansicht)

Aufgrund genomischer Unterschiede wurde die Familie vom ICTV von der ehemaligen Familie Siphoviridae der Viren von Siphoviren-Gestalt abgetrennt.[7]

Systematik

Die Systematik der Drexlerviren ist nach ICTV (Unterfamilien und Gattungen; Spezies und Stämmen auszugsweise; ergänzt um einige Vorschläge nach NCBI in Anführungszeichen, Stand 4. November 2023) wie folgt:[4][8][9]

Klasse: Caudoviricetes, Familie: Drexlerviridae

  • Unterfamilie: Braunvirinae (benannt nach Volkmar Braun)
      • Spezies: Escherichia-Virus ACGM12
        • Enterobacteria-Phage vB_EcoS_ACG-M12
    • Gattung: Christensenvirus
      • Spezies Escherichia-Virus IME542 (wiss. Christensenvirus IME542)
    • Gattung: Guelphvirus
      • Spezies: Escherichia-Virus ACGM12 (wiss. Guelphvirus ACGM12)
      • Spezies: Escherichia-Virus EC3a (wiss. Guelphvirus EC3a)
    • Gattung: Loudonvirus
      • Spezies: Escherichia-Virus DTL (wiss. Loudonvirus DTL)
    • Gattung: Rtpvirus (alias Rtplikevirus) – abgetrennt von Tunalikevirus (jetzt Tunavirus, damals noch zur früheren Familie Siphoviridae)
      • Spezies Escherichia-Virus IME253 (wiss. Rtpvirus IME253)
      • Spezies Escherichia-Virus Rtp (wiss. Rtpvirus Rtp, ehem. Typus)
        • Escherichia-Phage Rtp
      • Spezies „Escherichia-Phage vB_EcoD_SU57“ (en. „Escherichia phage vB_EcoD_SU57“)[10][11] – gemäß Koonjan et al. (2020) zu Tunavirus, nach ICTV und NCBI aber davon abgetrennt
    • Gattung: Veterinaerplatzvirus
      • Spezies: Escherichia-Virus 12210I (wiss- Veterinaerplatzvirus vv12210I)
  • Unterfamilie: Rogunavirinae
    • Gattung: Eastlansingvirus
      • Spezies: Shigella-Virus Sf12 (wiss. Eastlansingvirus Sf12)
    • Gattung: Lindendrivevirus
      • Spezies Escherichia-Virus Eb49 (syn. Escherichia-Virus phiEB49, wiss. Lindendrivevirus EB49)
    • Gattung: Rogunavirus (veraltet: Rogue1virus, Jk06likevirus)[12]
      • Spezies: Escherichia-Virus AHP42 (wiss. Rogunavirus AHP42)
        • Escherichia-Phage AHP42
        • Escherichia-Phage vB_EcoS_AHP42
      • Spezies: Escherichia-Virus AHS24 (wiss. Rogunavirus AHS24)
        • Escherichia-Phage AHS24
        • Escherichia-Phage vB_EcoS_AHS24
        • Escherichia-Phage bV_EcoS_AHP24
      • Spezies: Escherichia-Virus AKS96 (wiss- Rogunavirus AKS96)
        • Escherichia-Phage vB_EcoS_AKS96
      • Spezies: Escherichia-Virus C119 (wiss. Rogunavirus C119)
        • Escherichia-Phage C119
      • Spezies: Escherichia-Virus E41c (wiss. Rogunavirus E41c)
        • Escherichia-Phage e4/1c
      • Spezies: Escherichia-Virus Jk06 (wiss. Rogunavirus Jk06)
        • Escherichia-Phage Jk06
      • Spezies: Rogunavirus JLA23
      • Spezies: Escherichia-Virus KP26 (wiss. Rogunavirus KP26)
        • Enterobacteria-Phage KH4
        • Enterobacteria-Phage phiJLA23
        • Enterobacteria-Phage phiKP26
      • Spezies: Escherichia-Virus Rogue1 (wiss. Rogunavirus rogue1)
        • Escherichia-Phage Rogue1
        • Enterobacteria phage vB_EcoS_Rogue1
    • Gattung: Wilsonroadvirus
    • Spezies Shigella-Virus Sd1 (wiss. Wilsonroadvirus Sd1)
  • Unterfamilie: Tempevirinae
    • Gattung: Changchunvirus
      • Spezies: Changchunvirus PHB17
      • Spezies Changchunvirus W011D
    • Gattung: Hanrivervirus (14 Spezies)
      • Spezies: Hanrivervirus haarsle
      • Spezies: Hanrivervirus henu8
      • Spezies: Hanrivervirus herni
    • Gattung: Henuseptimavirus
      • Spezies: Escherichia-Virus Henu7 (wiss. Henuseptimavirus henu7)
      • Spezies „Klebsiella-Phage vB_KaS-Ahsoka“ (en. „Klebsiella phage vB_KaS-Ahsoka“)
      • Spezies „Klebsiella-Phage vB_KaS-Gatomon“ (en. „Klebsiella phage vB_KaS-Gatomon“)
      • Spezies „Klebsiella-Phage vB_KppS-Samwise“ (en. „Klebsiella phage vB_KppS-Samwise“)
    • Gattung: Tlsvirus (alias Tlslikevirus, 10 Spezies)
      • Spezies: Escherichia-Virus TLS (wiss. Tlsvirus TLS, ehem. Typus)
        • Escherichia-Phage Tls
      • Spezies: Salmonella-Virus SP126 (wiss. Tlsvirus SP126)
        • Salmonella-Phage FSL SP-126
    • Gattung: Warwickvirus (12 Spezies)
      • Spezies Escherichia-Virus 95 (wiss. Warwickvirus wv95)
      • Spezies Escherichia-Virus mar001J1 (wiss. Warwickvirus mar001J1)
      • Spezies Escherichia-Virus SECphi27 (wiss. Warwickvirus SECphi27)
      • Spezies Escherichia-Virus swan01 (wiss. Warwickvirus swan01, ehem. Typus)
      • Spezies Escherichia-Virus SLUR29 (wiss. Warwickvirus SLUR29)
        • Escherichia-Phage vB_Eco_SLUR29 (en. Escherichia phage vB_Eco_SLUR29)[13][14]
  • Unterfamilie: Tunavirinae
    • Gattung: Badaguanvirus
      • Spezies Escherichia-Virus IME347 (wiss. Badaguanvirus IME347)
    • Gattung: Sertoctavirus
      • Spezies Escherichia-Virus SRT8 (wiss. Sertoctavirus SRT8)
    • Gattung: Tunavirus (veraltet: T1virus, Tunalikevirus, T1-like viruses, T1-like phages, T1-ähnliche Viren, 16 Spezies),[15][16] isometrisches Kapsid
      • Spezies Escherichia-Virus ADB2 (wiss. Tunavirus ADB2)
      • Spezies Escherichia-Virus BIFF (wiss. Tunavirus BIFF)
      • Spezies Escherichia-Virus IME18 (wiss. Tunavirus IME18)
      • Spezies Escherichia-Virus JMPW1 (wiss. Tunavirus JMPW1)
      • Spezies Escherichia-Virus JMPW2 (wiss. Tunavirus JMPW2)
      • Spezies Escherichia-Virus SH2 (wiss. Tunavirus SH2)
      • Spezies Escherichia-Virus T1 (wiss. Tunavirus T1, ehem. Typus)[17]
        • Enterobacteria-Phage T1
      • Spezies Shigella-Virus 008 (wiss. Tunavirus tv008)
      • Spezies Shigella-Virus ISF001 (wiss. Tunavirus ISF001)
      • Spezies Shigella-Virus ISF002 (wiss. Tunavirus ISF002)
      • Spezies Shigella-Virus PSf2 (wiss. Tunavirus PSf2)
      • Spezies Shigella-Virus Sfin1 (wiss. Tunavirus Sfin1)
      • Spezies Shigella-Virus Sfin3 (wiss. Tunavirus Sfin3)
      • Spezies Shigella-Virus SH6 (wiss. Tunavirus SH6)
      • Spezies Shigella-Virus Shfl1 (wiss. Tunavirus Shfl1)
      • Spezies „Campylobacter-Phage A15b“ (en. „Campylobacter phage A15b“)
    • ohne Gattungszuweisung:
      • Spezies „Campylobacter-Phage A15b“ (en. „Campylobacter phage A15b“)
  • ohne zugewiesene Unterfamilie
    • Gattung: Eclunavirus
      • Spezies: Eclunavirus EcL1
    • Gattung: Hicfunavirus
      • Spezies: Hicfunavirus HCF1
    • Gattung: Jhansiroadvirus
      • Spezies Jhansiroadvirus gwaliVC1
    • Gattung: Kyungwonvirus (inkl. frühere Gattung Gyeonggidovirus)
      • Spezies: Cronobacter-Virus Esp2949-1 (wiss. Kyungwonvirus Esp29491)
      • Spezies: Cronobacter virus PhiCS01 (wiss. Kyungwonvirus CS01, früher zu Gyeonggidovirus)
    • Gattung: Nouzillyvirus
      • Spezies: Escherichia virus ESCO41
    • Gattung: Sauletekiovirus
      • Spezies: Pantoea-Virus AAS23 (en. Pantoea virus AAS23)
    • Gattung: Vilniusvirus
      • Spezies: Escherichia-Virus NBD2 (en. Escherichia virus NBD2)
    • Gattung: Webervirus (veraltet: Kp36virus, Kp36likevirus, 32 Spezies)
      • Spezies Enterobacteria-Virus F20 (en. Enterobacteria virus F20)
      • Enterobacteria-Phage F20
      • Spezies Klebsiella-Virus KP36 (en. Klebsiella virus KP36, ehem. Typus)
        • Klebsiella-Phage KP36
      • Spezies Klebsiella-Virus KP1801 (en. Klebsiella virus KP1801)
      • Spezies Klebsiella-Virus KpCol1 (en. Klebsiella virus KpCol1)
      • Spezies Klebsiella-Virus KpKT21phi1 (en. Klebsiella virus KpKT21phi1)
      • Spezies Klebsiella-Virus KPN N141 (en. Klebsiella virus KPN N141)
      • Spezies Klebsiella-Virus KpV522 (en. Klebsiella virus KpV522)
      • Spezies Klebsiella-Virus Shelby (en. Klebsiella virus Shelby)
      • Spezies Klebsiella-Virus Sushi (en. Klebsiella virus Sushi)
      • Spezies Klebsiella-Virus Sweeny (en. Klebsiella virus Sweeny)
    • ohne Gattungszuweisung:
      • Spezies „Erwinia-Phage Snitter“ (en. „Erwinia phage Snitter“)
      • Spezies „Klebsiella-Phage KL3“ (en. „Klebsiella phage KL3“)
      • Spezies „Klebsiella-Phage KMI8“ (en. „Klebsiella phage KMI8“)
      • Spezies „Klebsiella-Phage vB_KpnS_SXFY507“ (en. „Klebsiella phage vB_KpnS_SXFY507“)
      • Spezies „Pseudomonas-Phage Motto“ (en. „Pseudomonas phage Motto“)
      • Spezies „Salmonella -Virus STSR3“ (en. „Salmonella virus STSR3“)

Einzelnachweise

  1. ↑ ICTV: ICTV Master Species List 2021.v2, New MSL including some corrections.
  2. ↑ a b ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
  3. ↑ ICTV: ICTV Master Species List 2020.v1, New MSL including all taxa updates since the 2019 release, March 2021 (MSL #36)
  4. ↑ a b ICTV: Taxon Details: Family: Drexlerviridae.
  5. ↑ UniProt: Taxonomy - Drexlerviridae (FAMILY)
  6. ↑ Dann Turner, Andrew M. Kropinski, Evelien M. Adriaenssens: A Roadmap for Genome-Based Phage Taxonomy, in: MDPI Viruses Band 13, Nr. 3, Section Bacterial Viruses, 18. März 2021, 506, doi:10.3390/v13030506
  7. ↑ a b ICTV: Create one new family (Drexlerviridae), Proposal
  8. ↑ ICTV: Taxonomy Browser.
  9. ↑ NCBI: Drexlerviridae (family)
  10. ↑ NCBI: Escherichia phage vB_EcoD_SU57 (species)
  11. ↑ Shazeeda Koonjan, Fredrik Seijsing, Callum J. Cooper, Anders S. Nilsson: Infection Kinetics and Phylogenetic Analysis of vB_EcoD_SU57, a Virulent T1-Like Drexlerviridae Coliphage, in: Front. Microbiol. 11:565556, 16. November 2020, doi:10.3389/fmicb.2020.565556, PMID 33329423, PMC 7718038 (freier Volltext). Mit EM-Aufnahme.
  12. ↑ NCBI: Rugunavirus (genus)
  13. ↑ NCBI: Escherichia phage vB_Eco_SLUR29 (species)
  14. ↑ Ibrahim Besler, Pavelas Sazinas, Christian Harrison, Lucy Gannon, Tamsin Redgwell, Slawomir Michniewski, Steven P. Hooton, Jon L. Hobman, Andrew Millard; Mary Ann Liebert (Hrsg.): Genome Sequence and Characterization of Coliphage vB_Eco_SLUR29, in: PHAGE, Band 1, Nr. 1, 28. Februar 2020, doi:10.1089/phage.2019.0009. Dazu:
  15. ↑ NCBI: unclassified Tunavirinae (list)
  16. ↑ SIB: Tunavirus. Auf: ViralZone.
  17. ↑ ICTV: ICTV Taxonomy history: Escherichia virus T1
source: https://de.wikipedia.org/wiki/Drexlerviridae